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国家出入境检验检疫局卫生监管司是国家出入境检验检疫局的下属部门之一，其主要职责是：
研究拟定出入境卫生检疫和进出口食品卫生监督检验的规章、制度；组织实施出入境卫生检疫。传染病监测和卫生监督；收集国外有关传染病的疫情信息；组织实施进出口食品卫生、质量检验和监督管理，管理进出口食品卫生注册登记。