江苏省微生物资源产业化工程技术研究中心前身是由2007年7月11日南京市科技局批准组建的南京市微生物工程技术研究中心，依托单位为南京师范大学。

工程中心现有固定研发人员26人，其中具有博士学位22人,教授15人，副教授6人，讲师5人。中心下设微生物功能食品开发利用研究室、微生物药物研究室、基因工程与发酵工程研究室。中心建立了微生物资源产业化研发公用技术平台，中试车间和新产品生产基地，可开展各种微生物发酵产品的技术攻关和产业化研究。

中心与南京高固食用菌科贸有限公司、南京仙奕基因科技有限公司、江苏亚星锚链股份有限公司、常州阿格罗生物科技公司、句容市九龙药材有限公司等十六家企事业单位合作，通过技术转让、联合开发、委托研究、科技服务等方式开展产学研合作项目17项，从企业获得研发经费共计1276.6万元。同时和企业联合申报获得国家发改委高技术专项微生物制造专项课题、国家科技部中小企业创新基金项目等国家以及一些省市重大重点项目，经费共计达619万元。通过新产品或新技术的开发和推广应用使企业新增产值4740万元。