克隆重叠群
克隆重叠群
克隆重叠群（clone contig），又叫克隆叠连群，是在基因测序中的一个概念。
DNA测序不能从染色体进行，首先必须克隆化，构建基因组的物理图谱。先构建片段DNA克隆（以YAC或BAC为载体），并把克隆依染色体排序，这就是“染色体的克隆图”。依片段DNA克隆在染色体上所在的位置排序，可以得到相互重叠的一系列克隆，叫做“克隆重叠群”。
在大规模DNA测序中，目标DNA分子的长度可达上百万个bp。现在还不能直接测定整个分子的序列，然而，可以得到待测序列的一系列序列片段。序列片段是DNA双螺旋中的一条链的子序列（或子串）。这些序列片段覆盖待测序列，并且序列片段之间也存在着相互覆盖或者重叠。在一般情况下，对于一个特定的片段，我们不知道它是属于正向链还是属于反向链，也不知道该片段相对于起点的位置。另外，这样的序列片段中还可能隐含错误的信息。序列片段的长度范围300~1000 bp，而目标序列的长度范围是3100万bp，总的片段数目可达上千个。
DNA序列片段组装（sequence assembly），又称序列拼接，其任务就是根据这些序列片段，重建目标DNA序列。如果能够得到DNA一条链的序列，那么根据互补原则，另一条链的序列也就得到了。