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专业行政机关是负责组织和管理某一方面行政事务的机关。其行政活动带有局部性和专门性，是直接完成机关目标的行政单位。它的主要任务是贯彻执行一般性行政机关的决定和指示，领导或在业务上指导所属行政部门的工作。
例如 我国国务院下属的各部、委员会、办公室及省人民政府下属的各厅、局和县人民政府下属的各局、科等属于专业行政机关。